Как умирают русские солдаты (1854, опубликовано 1928)
Записки маркёра (1855)
Рубка леса (1855)
Севастопольские рассказы (1855—1856)
Севастополь в декабре месяце
Севастополь в мае
Севастополь в августе 1855 года
Метель (1856)
Разжалованный (1856)
Люцерн (1857)
Три смерти (1859)
Отрывки рассказов из деревенской жизни (1860—1862, опубликовано 1932)
Холстомер (1863—1885, опубликовано 1886)
Бог правду видит, да не скоро скажет (1872)
Кавказский пленник (1872)
Две лошади (1880)
Прыжок (1880)
Рассказ Аэронавта (1880)
Суратская кофейная (1887, опубликовано 1893)
Дорого стоит (переделка отрывка из очерка Г. де Мопассана «На воде», 1890; опубликовано 1899 в Англии, в России 1901)
Франсуаза (переделка рассказа Г. де Мопассана «Порт», 1891)
Кто прав? (1891—1893, опубликовано 1911)
Карма (1894)
Сон молодого царя (1894, опубликовано 1912)
После бала (1903, опубликовано 1911)
Алёша Горшок (1905, опубликовано 1911)
Бедные люди (1905)
Божеское и человеческое (1906)
За что? (1906)
Корней Васильев (1906)
Ягоды (1906)
Что я видел во сне (1906, опубликовано 1911)
Отец Василий (1906, опубликовано 1911)
Сила детства (1908, опубликовано 1912)
Разговор с прохожим (1909, опубликовано 1910)
Проезжий и крестьянин (1909, опубликовано 1917)
Песни на деревне (1909, опубликовано 1910)
Три дня в деревне (1909, опубликовано 1910)
Ходынка (1910, опубликовано 1912)
Нечаянно (1910, опубликовано 1911)
Благодарная почва (1910)
Философско-нравоучительные рассказы и притчи.
Чем люди живы (1881)
Два брата и золото (1885, опубликовано 1886)
Ильяс (1885, опубликовано 1886)
Где любовь, там и Бог (1885)
Вражье лепко, а божье крепко (1885)
Девчонки умнее стариков (1885)
Упустишь огонь — не потушишь (1885)
Два старика (1885)
Свечка (1885, опубликовано 1886)
Сказка об Иване-дураке и его двух братьях: Семёне-воине и Тарасе-брюхане, и немой сестре Маланье, и о старом дьяволе и трёх чертенятах (1885, опубликовано 1886)
Три старца (1886)
Как чертёнок краюшку выкупал (1886)
Кающийся грешник (1886)
Зерно с куриное яйцо (1886)
Много ли человеку земли нужно (1886)
Крестник (1886)
Работник Емельян и пустой барабан (1886, опубликовано 1891)
Три сына (1887, опубликовано 1889)
Три притчи (1895)
Две различные версии истории улья с лубочной крышкой (1900, опубликовано 1912)
Разрушение ада и восстановление его (1902, опубликовано 1903)
Ассирийский царь Асархадон (1903)
Волк (1908, опубликовано 1909)
Учебная литература и дидактические пособия.
Азбука (1872)
Новая Азбука (1875)
Три медведя
Как дядя Семен рассказывал про то, что с ним в лесу было
Корова
Филипок
Арифметика (1875)
Первая русская книга для чтения (1875)
Вторая русская книга для чтения (1875)
Третья русская книга для чтения (1875)
Четвёртая русская книга для чтения (1875)
Пьесы.
Заражённое семейство (1864)
Нигилист (1866)
Власть тьмы, или Коготок увяз, всей птичке пропасть (1886)
Драматическая обработка легенды об Аггее (1886)
Первый винокур, или Как чертенок краюшку заслужил (1886)
Плоды просвещения (1890)
Пётр Хлебник (1894)
Живой труп (1900)
И свет во тьме светит (1890—1900)
От ней все качества (1910)
Стихи.
Песня про сражение на реке Черной 4 августа 1855 г. (1855)
Дурень. Стихи-сказка («Задумал дурень…» 1879)
Религиозно-философские произведения.
Четвероевангелие: Соединение и перевод четырёх Евангелий, 1880—1881 гг.
Исповедь, 1882 г.
В чём моя вера? (1883—1888)
Царство Божие внутри вас — трактат, 1890—1893[1]
Краткое Изложение Евангелия, 1906
Путь жизни, 1910
Статьи, публицистика.
Проект о переформировании армии (1855)
Записка о дворянском вопросе (1858)
Речь в Обществе любителей российской словесности (1859)
О народном образовании (1861)
Кому у кого учиться писать, крестьянским ребятам у нас или нам у крестьянских ребят? (1862)